Но такое объединение привело к гибели части пчел и исчезновению обеих маток. В чем состоит ошибка пчеловода?

Объединять таким способом семьи надо не перед медосбором, а в первые дни приноса нектара в улей. При отсутствии приноса корма, что можно проследить при взвешивании контрольного улья, объединять семьи не следует.